伊斯兰教在新疆的传播大致经历了喀喇汗王朝、察合台汗国和叶尔羌汗国三个时期，至明末，先后有维吾尔、()、柯尔克孜、塔吉克、塔塔尔、乌孜别克等6个民族信仰，成为新疆占统治地位的宗教。随着回、东乡、撒拉、保安等民族穆斯林的迁入，目前新疆信仰伊斯兰教的民族已达10个。